Я б радив проводити заміну вікон на самому початковому етапі. Вся чорнова робота, а заміна вікон, мабуть, відноситься до такої, повинна проводитися в самому початку поряд зі зміною підлог (не покриття ламінатом або іншим матеріалом, а саме заміна підстави), заміна або ремонт батарей, заміна дверей і тому подібні роботи.
До того ж, заміну вікон дуже складно зробити самим, особливо без відповідної підготовки, тому до Вас прийдуть робітники, мінімум двоє, а швидше за все, більше. Вони завдадуть будинок/квартиру купу бруду і, якщо у Вас вже буде свіженька оздоблення, напевно, вони що-небудь, так зіпсують. До того ж, перед установкою нових вікон, процедурою, яку ще можна зробити порівняно чисто, буде слідувати демонтаж вікон, а в цьому випадку буде дуже пильно і брудно, запачкают не тільки підлоги, але і стіни, двері і все, що попадеться під руку.
Тому, якщо ви робите капітальний ремонт, моя порада - починайте з вікон.