Дуже шкода, але судячи з вашого опису, ваші шпоновані двері не найвищої якості виготовлення. Мабуть не подряпини це зовсім, а дійсно маленькі тріщинки, що говорить про те, що при виготовленні дверей був порушений техпроцес. Як правило, таке відбувається при невідповідності нормам вологості деревини, шпону або на поверхні, на яку він був наклеєний. Або про поганих умовах експлуатації даних дверей, з мінливою температурою і вологістю навколишнього середовища. У будь-якому випадку цей процес буде важко зупинити, як би не закладати ці тріщини. Потрібно постаратися не змінювати умов утримання дверей після реставрації. У ванну кімнату так взагалі не рекомендується ставити такі двері з-за перепадів вологості повітря. Судячи по наявності плям на дверях, то можна зробити висновок, що і лако-фарбове покриття не кращої якості.
Порада одна - потрібно підібрати герметик по дереву, бажано точно підходить за кольором, і акуратно замазати вручну тріщини, стираючи надлишки вологою ганчіркою. Шпаклівку не рекомендую, трісне і вивалиться.. Плями усунути не вдасться, тільки при перефарбовуванні дверей в більш темний колір.