Є таке поняття як "покриваність фарби, тобто здатність ЛКМ (фарби в даному випадку) перекривати колір поверхні на яку вона наноситься.
Укривистість у різних фарб різна (за складом), значить у Вашому конкретному випадку та сама покриваність не достатня, потрібен другий, а можливо і третій шар фарби що б перекрити (закрити) колір поверхні, тобто шпаклівки.
Тут ще й колір фарби може вплинути на результат, приміром біла фарба, шпаклівка сіра, необхідно мінімум два шари з просушуванням першого що б повністю перекрити колір основи.
Приберіть пил з поверхні, купіть точно таку ж фарбу за складом і далі за допомогою пензлів, або валика або фарбопульта фарбуйте поверхню повторно.
Шпаклівка повинна бути урівень з основною поверхнею,