Ви не конкретизували яка водна фарба чи ні. Під водну акрилову фарбу можна ґрунтувати розведеної акрилової в/д емаллю 1:1. але краще прогрунтувати аквалазурью. Якщо акрилова фарба не на воді, а на розчиннику, то грунтувати слід акриловим лаком або емаллю, сильно розбавлених ксилолом (на 50-100%)- до низької в'язкості. Така грунтовка не повинна утворювати шару. Ксилол - сильнопахнующий розчинник, тому цій грунтовкою працювати потрібно в провітрюваному приміщенні і з засобами захисту органів дихання. Запах з приміщення зникне через 5-14 днів. Дана ґрунтовка підійде і під водне фарбування і спсет у разі, якщо деревина виділяє жовтизну.
В крайньому випадку можна використати і звичайну проникаючу грунтовку. У будь-якому випадку дерев'яна поверхня повинна висохнути близько доби. Після грунтовки поверхню стане шорсткою. її потрібно буде злегка обробити дрібним наждачним папером, намагаючись не пошкодити плівку грунту.